鎌倉時代には、若狭の浦うら所有の廻船の活発な動きにみるべきものがあった。古くから港津としては気山津（美浜町・三方町）が知られたが、南北朝ころよりしだいに衰退して、かわって小浜湊が発展することとなった。応永十五年（一四〇八）、小浜に来着した南蛮船は、旧港（スマトラ島のパレンバン）宣慰使施進卿という華僑の頭目とみられる者の派遣船である。そのころ小浜にはすでに問屋も存在していた。敦賀と同様に、中世末には蝦夷地との海運も開け、近世初期には秋田・南部などとの貨物運送取引も盛んとなった。近世に入ると、畿内と北陸・東北を結ぶ中継港として初期の豪商も活躍した。西廻り航路の発達により影響を受けたことも敦賀と同様である。